Die Universitätsmedizin Mainz bietet seit dem Wintersemester 2004/2005 einen postgradualen Masterstudiengang und seit dem Wintersemester 2010/2011 einen konsekutiven Masterstudiengang im Fach Epidemiologie an.
Seit dem Wintersemester 2008/2009 wird der weiterbildende Masterstudiengang Medizinethik angeboten.
Zum Wintersemester 2012/2013 hat die Universitätsmedizin den Masterstudiengang Biomedizin, der bis dahin am Fachbereich Biologie verortet war, übernommen.
Der neue Bachelorstudiengang Hebammenwissenschaft wurde zum Wintersemester 2023/2024 etabliert.
Der weiterbildende Masterstudiengang Personalisierte Orale Implantologie und Parodontologie wird ab Wintersemester 2024/2025 angeboten.
Darüber hinaus ist die Universitätsmedizin an dem Bachelor- und Masterstudiengang Psychologie und dem Bachelorstudiengang Biomedizinische Chemie, die jeweils von anderen Fachbereichen der Johannes Gutenberg-Universität durchgeführt werden, durch das Angebot von Lehrveranstaltungen maßgeblich beteiligt.