Promotionsbörse

Klinik/Institut: Hautklinik und Poliklinik
Thema der Promotion:  Multiple Bioinformatics Projects available
Startzeitpunkt: 01.01.2026
Voraussichtliche Dauer (in Monaten): up to 24, full time can be done but is not a must davon in Vollzeit: 6
Methoden:  Learn how to code/Increase your skills in python/R · Get trained and perform: bioinformatic analyses · Machine Learning, bioAI · Functional genomics, single-cell and bulk level · Quality Control for functional genomics, batch effect correction · Biosecurity and Ethics
Zielsetzung: The projects we could work on range from analysis of regulatory mechanisms in disease or healthy immune cells to the application of mathematical transformations on DNA sequences to train Machine learning models on downstream tasks such as classification or clustering of sequences. If you have your own project idea in this direction and seek supervision or guidance, we are happy to discuss them!
Strukturierte Betreuung (z. B. Promotionskolleg, Doktorandenseminar, Journal Clubs, Retreats): Close supervision and support from bioinformaticians, cellular biologists, Immunologists. Participation in weekly lab meetings and our groups bio and discussion clubs. Weekly doctoral institute seminars, HPC cluster access.
Anforderungen(z. B.Freisemester, Sozietätenbesuch, versuchstierkundlicher Kurs): Medical studies at Mainz University Medical Center is mandatory. A semester off is not required but will likely lead to longer project time, projects can be worked on hybrid. Coding ability will be seen as a plus but not mandatory for all projects.
Autorenschaft (z. B.Publikation geplant, Erst- oder Koautorschaft möglich):  Publication and authorship possible and aimed for
Doktorvater: Prof. Dr. Johannes Mayer
Ansprechpartner: Dr. Maximilian Sprang​​​​​​​

Klinik/Institut: Hautklinik und Poliklinik & Forschungszentrum für Immuntherapie 
Thema der Promotion:  Etablierung neuer Zellkulturmethoden für die Untersuchung von Tumoren und Immunzell-Interaktionen
Startzeitpunkt: 31.10.2025
Voraussichtliche Dauer (in Monaten): 6-9 davon in Vollzeit: 7
Methoden:  Auf der Suche nach einer Experimentellen Doktorarbeit (MD)? Interessierst du dich für wissenschaftliche Forschung? Hast du Lust eigene Experimente durchzuführen? Hast du dich schon immer gefragt, wie sich Zellen in Kultur verändern und welche Limitationen Zellkulturexperimente haben? Findest du es spannend Immunzell-Interaktionen und Tumore näher zu verstehen? Dann haben wir ein spannendes Forschungsprojekt für dich in dem es darum geht • 2D und 3D Modelle von Tumorzellen zu vergleichen • das Tumor-Sekretom detailliert zu analysieren • Unterschiede zwischen Zellkultur und ‘echten’ Tumoren herausarbeiten (entweder im Labor oder dank Bioinformatik) • Immunzellen zu kultivieren und Veränderungen ihrer Interaktionen mit Tumorzellen zu untersuchen
Zielsetzung: Mitbringen musst du Interesse am Projekt, gutes Analytisches Denken, Durchhaltevermögen, gute Feinmotorik, belastbare Englischkenntnisse und ein Freisemester. Angebot gilt nur für Studierende der unimedizin Mainz. Arbeitserfahrung im Labor ist nicht erforderlich. Weitere Infos über uns findest du unter www.mayer-lab.com

Weitere Informationen erhalten Sie über folgenden Link​​​​​​​(PDF 481,9 KB)
​​​​​​​
Ansprechpartner:  Prof. Dr. Johannes Mayer

Klinik/Institut: Hautklinik und Poliklinik
Thema der Promotion:  Combining flow cytometric and transcriptomic analysis of murine and human regulatory T cells to define biomarkers of Treg dysfunction in ageing
Startzeitpunkt: 2025/Anfang 2026
Voraussichtliche Dauer (in Monaten): 6-9 davon in Vollzeit: 6
Methoden:  Learn how to work in an experimental cell biology laboratory setting to identify and isolate Tregs from human PBMC and murine lymphoid organs · Get trained and perform cell based immunological methods including flow cytometry and FACS · Molecular biology tasks: Isolation of RNA for sequencing · Molecular in-silico tasks (with the help of our lab bioinformaticians) on assessing RNA quality and performing sequence analysis · Contribution to ethical application to obtain fresh blood from different age groups of healthy individuals
Zielsetzung: Performing method establishment in the context of experimental biology with the support of experts will build the foundation for the thesis. Samples from donors (human and mice) will be collected after ethical approval and analysed on their differential expression. A new cell biology method will be established to stain and sort human and murine regulatory Tregs and fix them in specific conditions for transcriptomics analysis, providing an enhanced methodology to isolate Tregs in a new manner. In this project you will carry out experimental wet lab work, bioinformatic analysis and discuss your findings within the field of Treg Biology. An interest in experimental cell biology work, Immune cells, bioinformatics and attention to detail is mandatory.
Strukturierte Betreuung (z. B. Promotionskolleg, Doktorandenseminar, Journal Clubs, Retreats): Close supervision and support from cellular biologists, bioinformaticians. Participation in weekly lab meetings and our groups bio and discussion clubs. Weekly doctoral institute seminars.
Anforderungen(z. B.Freisemester, Sozietätenbesuch, versuchstierkundlicher Kurs): Medical studies at Mainz University Medical Center is mandatory. A semester off is required (ideally between M1 and M2)
Autorenschaft (z. B.Publikation geplant, Erst- oder Koautorschaft möglich):  Publication and authorship possible
Ansprechpartner:  André P. Heinen

Klinik/Institut: Klinik für Allgemein-, Viszeral- und Transplantationschirurgie
Thema der Promotion: Die Anwendung von Komplementärmedizin bei Patienten und Patientinnen mit Cholangiokarzinom
Voraussichtliche Dauer (in Monaten): 18-24 davon in Vollzeit: 1
Methoden: Befragungsstudie (Entwicklung der Studie von Beginn an, Erstellung eines Studienplans für eine Querschnittstudie, Diskussion einer geeigneten Fallzahl, Durchführung der Studie und Sammlung der Daten, Auswertung der Studie und schlussendlich auch Veröffentlichung bzw. Vorstellung der Daten)
Ansprechpartner: Frau  Dr. Ann-Kathrin Lederer

_____________________________________________________________________________________

Klinik/Institut: Klinik für Allgemein-, Viszeral- und Transplantationschirurgie
Thema der Promotion: Das Spenderbild nach der Transplantation: Was denken Lebertransplantierte über den Spender ihres Organs?
Voraussichtliche Dauer (in Monaten): 18-24 davon in Vollzeit: 1
Methoden: Befragungs-/Interviewstudie (Beteilung am Projekt ab Beginn, Mithilfe bei Erstellung des Studienplans, Evaluation der möglichen Erfassungsmethoden, gemeinsame Vorbereitung eines Ethikantrages, Unterstützung bei der Durchführung des Projektes, Auswertung des Projektes, Veröffentlichung und Vorstellung der Daten)
Ansprechpartner: Frau   Dr. Ann-Kathrin Lederer